กระถางสำหรับบอนไซจิ๋ว ก็เช่นเดียวกับบอนไซทั่วไป ควรจัดหาให้เหมาะสมกับขนาด และรูปทรงของไม้ กระถางที่เหมาะสมสวยงามจะทำให้ต้นไม้ดูโดดเด่น มีคุณค่ามากยิ่งขึ้น ปัญหาคือหากระถางจิ๋วไม่ค่อยจะได้ซะด้วย กลุ้มเล็กๆ!!